有的學校在規定論文是否通過查重時，不僅要求全文重復率不能超過多少，還對每章重復率也有要求，以連續13個字與別的文章重復做為判斷依據的。 所以不能連續超過13字相同，否則就會標紅。
論文查重的基本算法，就是查重系統將所檢測的論文，與比對數據庫范圍中的文獻，按照一定的算法進行識別計算出重復率，并生成檢測報告單。
根據學校的要求，對于查重率的標準是不同的。 較寬松的學校，要求在20%-30%左右；較嚴格的學校，查重率控制在5%-10%以內。 此外，不同的學歷、不同類型的論文對檢測查重率的要求也是不同的。
不過，凡是論文寫作者已經將論文發表并被檢測系統收錄且著作權屬于作者的論文，一般情況下都會在去除本人已發表重復率的計算部分予以體現。 還有就是，隨著論文查重檢測系統的不斷發展與完善，其計算規則也越來越科學化與合理化，專業的論文查重檢測系統在檢測自己的文章算重復率接近于0可能性愈來愈大，該部分也通常會和其他引用部分一樣以其他字體進行標注，即作者自己的論文以及引用部分都會體現在論文檢測報告當中，可以說這樣也在最大程度上保障了論文寫作者的合法權益。
