值得一提的是，在“不合格論文”中，有部分論文是被專家直接判定為“完全不符合要求”的論文，即無論是從選題還是研究方法、論文的撰寫等方面，都不滿足碩士論文的基本要求，這些論文無一例外都是由作者學術態度和學術行為不端正所導致的。. 專家評語如“論文的工作量明顯不太夠，沒有對所提算法進行復雜性分析，更沒有跟其他相關算法進行性能比較。. （理學）”“論文中的2.2 節、2.3節的相關理論基本照搬網絡上的內容。.
從被抽檢的碩士學位論文中我們發現：不合格論文普遍有6個問題 1 1.分析問題和解決問題的能力不足 2 2.研究方法的科學性不足 3 3.學科基礎知識的系統性和扎實性不足 4 4.論文結構不嚴謹 5 1.格式不規范 6 2.語言不規范 7 3.引證不規范 8 1.參考的文獻數量不足 9 2.文獻綜述撰寫水平較低
理論性或研究深度不足。. 即論文在論述過程中，沒有對論題的理論基礎進行必要的分析介紹，理論基礎薄弱；缺乏理論框架，使論述顯得凌亂；論文的研究不夠深入，沒有對深層次的研究問題進行探究和解答，理論深度不夠和缺乏學術性。. 研究重點不突出。. 即論文論述沒有突出研究重點，缺乏問題意識，研究問題不明確，對論文觀點缺乏提煉等。. 專家評語如“缺乏嚴密的邏輯推導。. （法學）”“論證單薄，論文許多部分論證不到位，淺談輒止。. （教育學）”“論文的主要內容缺少合理的理論框架，顯得較混亂。. （歷史學）”“文章在內容和結構上嚴重地偏離了自己的主題。. （文學）”.
